Στην Πανεπιστηµιούπολη των Βουτών, στο Ηράκλειο, λειτουργεί από το 2007 ένα πλήρες αθλητικό κέντρο, το οποίο περιλαµβάνει κλειστό Γυµναστήριο 1.080 θέσεων και κλειστή πισίνα 25 µέτρων µε πέντε διαδροµές. Επιπλέον, το Πανεπιστήµιο Κρήτης έχει στην κατοχή του ένα γήπεδο ποδοσφαίρου κανονικών διατάσεων, µε πλαστικό χλοοτάπητα, στην περιοχή Άγιος Ιωάννης Κνωσού.